Tento druh, ktorý dorastá do dĺžky nie viac ako 2 m, je podstatne menší ako tuponosý šesťžiabry (Hexanchus griseus) a veľkooký šesťžiabrový (Hexanchus nakamurai), ktorý môže dorásť až do dĺžky 4.5 m.
Väčšina druhov žralokov má päť žiabrov, ale okrem ďalšieho orgánu má šesť žiabrov aj pílovité spodné zuby.
Prečítajte si tiež: 4 potápači si užijú vzácne stretnutie so žralokom šesťžiabrovým
Predošlý zmätok a nesprávna identifikácia šesťžiabrových žralokov, najmä veľkookého, bola rozptýlená štúdiom 1310 párov báz dvoch mitochondriálnych génov, uvádzajú autori štúdie publikovanej v Marine Biodiversity.
Vedci z Florida Institute of Technology, MarAlliance (Belize), Florida State University Coastal & Marine Laboratory a US National Marine Fisheries Service tvrdia, že hoci atlantické šesťžiabry vyzerajú ako tie, ktoré sa nachádzajú v Pacifiku (okolo Japonska) a v Indii. Oceán (Réunion a Madagaskar), sú geneticky také odlišné, ako je tuponosý šesťžiabry od veľkookého.